近年来学院瞄准国际研究前沿，聚焦畜牧产业重大科学和技术问题，为推动畜牧产业的优质高效发展贡献“动科智慧”。构建了世界主要家畜全基因组遗传变异数据库、世界山羊和绵羊的参考基因组图谱，成果获国家自然科学二等奖；创建了肉用胚胎多能干细胞、动物脂肪细胞、肌肉细胞的原代离体培养技术体系，筛选了一批可用于分子育种的肉品质调控关键因子，选育出优质肉猪、肉牛、肉羊新品系6个；自主培育的中国第一个乳用绵羊新品种——元生爱特奶绵羊新品种通过国家畜禽遗传资源委员会审定，西农莎能奶山羊纳入国家畜禽遗传资源品种名录，获批农业农村部兽（渔）用生物制品临床试验批件3个。研发出国内首款绵羊和黄牛液相育种芯片。建立了高效动物基因编辑技术平台，创制基因编辑绒山羊、滩羊育种新材料；制定了畜禽肠道健康标准和奶畜饲粮碳水化合物平衡指数体系；创制了新型鱼类纳米载基因工程靶向浸泡疫苗，突破了浸泡免疫大规模商业化的技术瓶颈；鲈鱼弹状病毒基因工程亚单位灭活疫苗（E.coli-G2株）已获得临床批件；合作培育了我国首批国审凡纳滨对虾新品种“科海1号”和“广泰1号”。反刍动物基因组进化研究入选中国生命科学十大进展。

十四五以来，主持国家重点研发项目6项，其中青年项目2项，获批国家自然科学基金94项,国家自然科学基金重点类项目9项；累计到位科研推广经费6.4亿元；以通讯作者单位发表CNS主刊论文2篇、CNS子刊水平的高质量论文41篇，获批国家专利172项，发布国家标准1项、部级行业标准1项、省级地方标准59项，有力支撑ESI我校植物学与动物学、分子生物学与遗传学2个学科进入全球前0.1‰。荣获国家自然科学奖二等奖1项、教育部高等学校科学研究优秀成果奖一等奖1项、陕西省科技进步奖一等奖4项。

积极培育草食家畜育种全国重点实验室、支持国家肉牛改良中心、农业农村部动物生物技术重点实验室、现代牛业生物技术与应用国家地方联合工程研究中心、国家肉牛改良中心、农业农村部动物生物技术重点实验室、畜禽资源（牛）评价利用重点实验室、动物生物育种国际农业联合研究中心、陕西省动物遗传育种与繁殖重点实验室等研究平台建设；成立中哈家畜生产与加工科技示范园(奶牛)、中哈畜牧业联合实验室和中哈畜禽资源创新利用联合实验室。支持《家畜生态学报》《中国牛业科学》《畜牧兽医杂志》《北方蚕业》4种学术期刊改革发展，其中《家畜生态学报》入选中文核心期刊，与中国农业科学院北京畜牧兽医研究所联合办刊《Animal Research and One Health》（AROH）。